Состояние балтийских вод начало ухудшаться в 1960-е гг., и с  того времени чистота и безопасность воды в нем резко упали. Основными загрязнителями как тогда, так и сейчас выступают промышленные отходы и сельхозхимикаты, поступающие в море вместе с речной водой.

Первые шаги к охране Балтийского моря были предприняты в 1974 году (Хельсинкская Конвенция), в 2007 году появился стратегический план по Балтийскому морю ХЕЛКОМ, в котором расписаны защитные экологически направленные действия балтийских стран до 2021 года. Но не все экологические проблемы смягчились, а со временем появились новые. Одной из них стала прогрессирующая эвтрофикация, угрожающая биоразнообразию Балтийского моря.

Попутно, каждая из стран, имеющих выход к морю, докладывает о постоянном засилии водорослей, вымирании морского дна и сокращении популяции рыб. Так что до «здорового» состояния Балтийскому морю еще очень далеко и ему крайне важна забота, особенно в условиях изменяющегося климата. Но силами одних НГО здесь не управиться, нужна постоянная государственная поддержка и непрерывное сотрудничество всех заинтересованных в чистоте моря сторон, чтобы остановить вымирание фауны, идущей бешеными темпами, которые подогреваются загрязнением среды обитания видов.